Sporen und Samen sind sich darin ähnlich, dass Pflanzen beide produzieren, um ihre Nachkommenschaft zu verteilen, sodass neue Organismen an anderen Orten als ihre Elternorganismen wachsen können. Sie unterscheiden sich darin, dass Sporen sehr klein und einzeln sind -zellige Strukturen, während die Samen relativ groß und mit einer Samenschale geschützt sind.
Aufgrund ihrer geringen Größe und ihres geringen Gewichts können Sporen, wie sie von Farnen und Schachtelhalmen produziert werden, vom Wind über weite Strecken getragen werden. Dadurch können sich diese Pflanzenarten effizient ausbreiten, aber einige Sporen können leicht in Gebieten landen, die zum Überleben nicht geeignet sind. Sporen haben nur eine Kopie von jedem Chromosom der Pflanze und wachsen zu einem kleinen Pflanzenstadium heran, das als Gametophyt bekannt ist. Diese geben Gameten frei und erhalten sie. Nach der Befruchtung wachsen die Eier an Ort und Stelle in den größeren Sporophyten, der zwei Kopien jedes Chromosoms hat. Dann setzen sie die Sporen frei.
Samen sind aufgrund ihrer Samenhülle viel größer und schwerer als Sporen. Diese schützen nicht nur die Pflanzenembryonen, sondern liefern ihnen auch ihre erste Nahrungsquelle. Der Embryo in einem Samen hat zwei Kopien jedes Chromosoms und wächst zu einem großen Sporophyten heran. Die Sporen von Samenpflanzen bleiben jedoch in der Pflanze erhalten und wachsen zu Fortpflanzungsstrukturen wie Blüten heran, die dann nach der Befruchtung Samen bilden.
