Samen haben im Vergleich zu Sporen deutliche Vorteile aufgrund ihrer harten äußeren Hüllen und inneren Strukturen, die als Endospermen bezeichnet werden und den eingeschlossenen Sämlingen essentielle Nährstoffe liefern. Samen kommen nur in Blütenpflanzen und Gymnospermen vor. Sie enthalten Embryonen tief in ihren Zentren, die von einem Sack mit Nährstoffen und Mineralien umgeben sind, der von einer harten Schutzhülle umgeben ist, die den wachsenden Samen vor Raub und lebensbedrohlichen Witterungseinflüssen schützt.
Die harten äußeren Schalen von Samen sind vielleicht ihr wertvollstes Gut. Saatschalen helfen, die wachsenden Sämlinge vor Schäden durch landwirtschaftliche Geräte und Maschinen, Austrocknung und Prädation durch Käfer, Insekten und Vögel zu schützen. Die Schalen schützen auch vor potenziell schädlichen Bedingungen wie Wind, starkem Regen, Frost und extremer Hitze. Diese harten äußeren Schalen sind auch beim Schutz von Arten in feuergefährdeten Gebieten sehr hilfreich: Im Gegensatz zu Sporen, die bei hohen Temperaturen welken und sterben, schützen Samen ihre inneren Embryonen vor der Zerstörung durch Brände, sodass sie sicher ruhen und weiterwachsen können. Auch die Endospermen in Samen tragen wesentlich zum Wachstum und Erfolg des eingeschlossenen Embryos bei. Endospermen versorgen die Sämlinge, ähnlich wie die menschliche Gebärmutter, mit den Nährstoffen und Mineralien, die sie zum vollständigen Wachstum und zur Entwicklung benötigen.