Je nach Art vermehren sich Seeanemonen entweder sexuell oder ungeschlechtlich. Bei der sexuellen Fortpflanzung werden Eier und Spermien durch den Mund freigesetzt. Die ungeschlechtliche Fortpflanzung erfolgt durch Längsspaltung, Doppelspaltung oder Fußverletzung. Seeanemonen haben keine freischwimmende Larvenform, sondern entwickeln ein Ei, das nach der Befruchtung zuerst zu einer Planula und dann zu einem sesshaften Polyp wird.
Bei Seeanemonen, die sich sexuell fortpflanzen, haben einige Arten getrennte Geschlechter, während andere protandrische Hermaphroditen sind, bei denen es sich um Männchen handelt, die sich später in Weibchen verwandeln. Sexuell reproduzierende Anemonen brüten oft im Sommer und fallen mit warmen Oberflächenwassertemperaturen zusammen. Warmes Wasser führt dazu, dass sich die Gonaden der Männchen auf ihren inneren Mesenterien vergrößern. Wenn die Gameten reifen, stimulieren die Männchen die Weibchen, Eier freizusetzen. Das befruchtete Ei wächst zu einer Planula heran, setzt sich auf einem Objekt ab und bildet einen Polypen, die neue Anemone.
Seeanemonen, die sich durch Längs- oder Doppelspaltung ungeschlechtlich vermehren, teilen sich entlang ihrer Länge in zwei Hälften, um zwei voll ausgebildete Individuen zu bilden. Wenn sich Seeanemonen durch Tretenrisse vermehren, brechen Teile ihrer Tretscheibe, ihrer zentralen Stütze, ab, setzen sich ab und wachsen zu neuen Anemonen heran. Da Seeanemonen meist sesshaft sind, wachsen Eltern und Nachkommen nahe beieinander und bilden Kolonien, die manchmal jahrzehntelang leben und wachsen.
