Hummer atmen durch Kiemen, die sich in einer Struktur namens Panzer befinden. Der Panzer befindet sich an der Spitze des Cephalothorax, der allgemein als Hummerkopf bezeichnet wird. Es gibt 20 Kiemenpaare, die im Inneren des Panzers in zwei Kiemenkammern unterteilt sind. Die Kiemen bestehen aus kurzen, feinen Fäden, die Sauerstoff direkt aus dem Wasser aufnehmen.
Wasser dringt durch Öffnungen an der Unterseite des Hummers in den Körper des Hummers ein. Das Wasser wird von einer Struktur, die Kiemenballenpresse oder Ballenpresse genannt wird, durch die Zweigkammern gedrückt. Der Wasserstrom, der normalerweise zum Kopf des Hummers fließt, kann umgekehrt werden, um die Kiemen und Kiemenkammern von Schmutz zu befreien. Der Wasserfluss führt auch Urin weg, der biochemische Signale über das Geschlecht, den Fortpflanzungszustand und das Häutungsstadium des Individuums enthält.
Die Kiemen des Hummers sind laut Wikipedia sehr empfindlich gegenüber Umweltkrankheiten, wie zum Beispiel Ausscheidungskalzinose, die dazu führt, dass sich Mineralien auf den Kiemen ansammeln. Dies tötet schließlich den Hummer, weil es die Sauerstoffaufnahme aus dem Wasser blockiert. Im Jahr 2002 kam es im Long Island Sound zu einem Ausbruch dieser Krankheit, von dem angenommen wurde, dass er durch wärmere Wassertemperaturen in der Nähe des Meeresbodens, dem natürlichen Lebensraum des Hummers, verursacht wurde.