Die mechanische Verdauung unterstützt die chemische Verdauung, indem sie Nahrung in kleinere Stücke mit einer größeren Oberfläche zerlegt und Enzyme einführt, um den Prozess der chemischen Verdauung zu beginnen. Beim Menschen findet ein Großteil der mechanischen Verdauung im Mund durch Kauen statt, bei dem die Zähne Nahrungsbestandteile aufbrechen.
Kauen zerkleinert nicht nur Lebensmittel, sondern vermischt sie auch mit Speichel, der sowohl Enzyme als auch Schleim enthält. Die Enzyme dienen in erster Linie dem Abbau von Kohlenhydraten. Der Schleim hilft, die zerkauten Nahrungspartikel zu einer halbfesten Masse zusammenzukleben, die als Bolus bekannt ist und leichter zu schlucken ist, als es das ursprüngliche Nahrungsmittel oft gewesen wäre. Es wandert hinunter in den Magen, wo eine weitere mechanische und chemische Verdauung stattfindet.
Der Magen verdaut den Bolus mechanisch durch einen Prozess, der als Peristaltik bekannt ist, eine Kontraktion der Magenwände, die den Bolus aufwirbelt und mit Magensäure und weiteren Enzymen, insbesondere Pepsin, das Proteine abbaut, vermischt. Dieser Prozess zerlegt den Bolus in eine Substanz, die als Chymus bekannt ist. Der Speisebrei wird durch den Magenboden freigesetzt und die darin enthaltene Magensäure wird neutralisiert. Die Flüssigkeiten im oberen Teil des Darms emulgieren Fett, eine andere Form der mechanischen Verdauung. Der Darm enthält auch weitere Enzyme zum Abbau von Kohlenhydraten und Proteinen.