Kohlenhydrate, Fette und Proteine sind alles Brennstoffe, die zur Durchführung des Atmungsprozesses verwendet werden können. Glukose wird auch häufig verwendet, um die an der Atmung beteiligten Wege und Reaktionen zu untersuchen.
Atmung ist der Prozess, bei dem Zellen die Energie gewinnen, die sie für Brennstoffzellenaktivitäten benötigen. Der Prozess wird als exotherm angesehen, was bedeutet, dass der gesamte Prozess im Körper in eine Reihe kleinerer Prozesse zerlegt werden kann. Bei der aeroben Atmung wird Sauerstoff benötigt, um ATP zu erzeugen, aber auch Kohlenhydrate, Fette und Proteine können während des Prozesses als Reaktionspartner verwendet werden.