Zu den Waffen, die während des Angriffs auf Pearl Harbor verwendet wurden, gehörten Bomben, Torpedos, Maschinengewehre und Flugabwehrgeschütze. Die japanischen Bomben und Torpedos wurden von zahlreichen Flugzeugen abgeworfen, darunter B5N2-Bomber und Aichi D3A1-Tauchbomber. Die Japaner benutzten auch A6M Model 21 Zeros, um Luftwaffenstützpunkte um Pearl Harbor zu beschießen.
Die größeren B5N2-Bomber trugen jeweils einen einzelnen Typ 91 Model 2-Torpedo. Diese Torpedos waren mit Holzflossen um ihre Propeller ausgestattet, die ihnen halfen, im seichten Wasser des Hafens zu operieren. Jeder Torpedo wog etwa 1.847 Pfund und hatte einen 452-Pfund-Sprengkopf. Der B5N2-Bomber hatte auch ein 30-Kaliber-Maschinengewehr im Heck des Flugzeugs, mit dem die Kanoniere Ziele beschossen, wenn der Bomber über ihm vorbeiflog.
Von den 89 Bombern der ersten Welle trugen 40 Torpedos vom Typ 91 Modell 2. Die anderen 49 Bomber trugen mehrere Bomben des Typs 91 Model 5 mit einem Gewicht von 1.763 Pfund. Die Modell-5-Bombe hatte die Fähigkeit, mehrere Decks des Zielschiffs zu durchdringen, wenn sie aus großer Höhe abgeworfen wurde.
Die kleineren Aichi D3A1-Tauchbomber trugen jeweils eine einzelne Typ 98-Landbombe mit einem Gewicht von 551 Pfund. Diese Bomben wurden speziell für den Angriff auf die Landebahnen und Luftwaffenstützpunkte um Pearl Harbor bestimmt. Nachdem die Sturzkampfbomber ihre Bomben abgeworfen hatten, beschossen sie gemeinsam mit den A6M Model 21 Zeros die Bodenziele mit ihren Maschinengewehren und 20-Millimeter-Kanonen.
