Saprotrophe Pilze nehmen Nährstoffe aus zerfallenden organischen Stoffen auf. Sie setzen Säuren und Enzyme frei, die abgestorbenes Gewebe in kleinere Partikel zerlegen, damit es absorbiert werden kann. Diese Pilze sind für die Nahrungskette äußerst wichtig, da sie dabei helfen, abgestorbene Stoffe wieder in den Boden zu recyceln.
Saprotrophes Verhalten ist eine der vier Arten, auf denen Pilze Nährstoffe aufnehmen. Myorrhiza-Pilze gehen symbiotische Beziehungen mit anderen Pflanzen und Tieren ein. Normalerweise ist die Beziehung wechselseitig, was bedeutet, dass beide Organismen davon profitieren. Der Pilz webt sich um die Wurzelzellen der Pflanze oder wickelt sich um die Wurzeln selbst. Der Pilz versorgt die Pflanze mit zusätzlicher Feuchtigkeit und Nährstoffen und erhält wiederum Zugang zu Zucker, den die Pflanze produziert. Endophytische Pilze gehen auch eine mutualistische Beziehung zu einer Wirtspflanze ein. Sie haben jedoch ihre eigene Kategorie, da sie im Gegensatz zu Myorrhiza-Pilzen ohne Wirtspflanze leicht in einem Labor kultiviert werden können. Parasitäre Pilze infizieren und ernähren sich von lebenden Organismen und töten sie schließlich.
