Der Hauptnachteil der asexuellen Fortpflanzung ist der Mangel an genetischer Vielfalt bei den resultierenden Nachkommen. Im Gegensatz zur sexuellen Fortpflanzung, bei der zwei verschiedene Gensätze rekombiniert werden, besitzt ein asexueller Organismus dasselbe Gene wie seine Eltern. Dies kann zu Problemen führen, wenn der Elternteil einen genetischen Defekt hat; Ohne einen anderen Elternteil, der das Gen ersetzt, besitzt auch der Nachwuchs den Defekt.
Asexuelle Fortpflanzung ist bei einfachen Organismen wie Bakterien häufiger als bei komplexen Organismen wie Säugetieren und Vögeln. Dennoch zeigen hochentwickelte Arten gelegentlich eine ungeschlechtliche Fortpflanzung. Eine Gruppe amerikanischer Eidechsen namens Whiptails, die in rein weiblichen Populationen vorkommen, veranschaulicht dieses Phänomen am besten. Diese Eidechsen haben jedoch mehr Chromosomen als die meisten anderen Eidechsen, was dazu beiträgt, die mit der asexuellen Fortpflanzung verbundenen Probleme auszugleichen.
Es gibt viele verschiedene Arten der ungeschlechtlichen Fortpflanzung. Einige Tiere, wie Schwämme, produzieren Strukturen, die Gemmule genannt werden, die sich in Tochterorganismen verwandeln. Andere Organismen wie Planarien vermehren sich durch den Prozess der Fragmentierung. Die Fragmentierung beinhaltet die Aufspaltung des Elternorganismus in zwei Tochterorganismen. Die Parthenogenese ist eine besondere Art der asexuellen Fortpflanzung, die auftritt, wenn sich eine unbefruchtete Eizelle zu einem Nachwuchs entwickelt. Parthenogenese wurde bei vielen verschiedenen Reptilien und Fischen dokumentiert.
