Eubakterien gelten laut Reference.com als "echte Bakterien". Sie zeichnen sich durch einen Mangel an Kernmembran, einzelnes kreisförmiges Chromosom und Zellwände aus Peptidogycan aus.
Ein beliebtes Klassifizierungssystem teilt alle Lebewesen in drei Domänen ein: Eubakterien, Archaeen und Eukaryoten. Das Wort "Eubakterien" leitet sich von den Wörtern "eu" ab, was "echt" und "Bakterien" bedeutet. Eubakterien sind Prokaryoten, das heißt, sie haben einen primitiven Zellkern. Das Kernmaterial von Bakterien ist nicht wie bei Eukaryoten durch eine eigene Kernmembran gebunden. Auch bakterielles genetisches Material oder die DNA liegt als einzelnes zirkuläres Chromosom vor.
Die Zellwand von Bakterien besteht aus Peptidoglycan, im Gegensatz zu Zellulose, wie bei Pflanzen. Sie sind einzellige Organismen und vermehren sich meist durch binäre Spaltung. Eubakterien sind entweder beweglich oder nicht beweglich. Das bewegliche Bakterium kann sich aufgrund des Vorhandenseins eines Flagellums bewegen.
Eubakterien können Sporen bilden, die es ihnen ermöglichen, unter widrigen Bedingungen lange zu überleben, stellt das Augusta Technical College fest. Eubakterien werden weiterhin entweder als gram-positive Bakterien oder als gram-negative Bakterien klassifiziert, je nachdem, ob sie eine Gram-Färbung aufnehmen oder nicht. Eubakterien und Archaebakterien haben sich aus einem gemeinsamen Vorfahren entwickelt, weisen jedoch genügend Unterschiede auf, um zwei separate Domänen bei der Klassifizierung von Lebewesen zu verdienen.