Die Vorteile des Pflanzenklonens sind: Es reproduziert krankheitsresistente Pflanzen, beschleunigt die Reproduktion in Pflanzen und reproduziert Pflanzen mit hohem Nährwert. Die Nachteile des Pflanzenklonens sind: Es ist teuer, erfordert spezielle Fähigkeiten, reproduziert genetisch identische Pflanzen und durch Klonen reproduzierte Pflanzen haben eine kurze Lebensdauer.
Das Klonen von Pflanzen beschleunigt die Fortpflanzung, da Pflanzen nicht den Gametenbildungsprozess durchlaufen müssen, damit eine Befruchtung stattfindet. Es ermöglicht den Landwirten auch, krankheitsresistente Pflanzen anzubauen, die den Einsatz von Pestiziden und Herbiziden minimieren und den wirtschaftlichen Verlust bei Krankheitsausbrüchen minimieren. Durch Klonen erzeugte Pflanzen werden hinsichtlich ihrer Qualität und ihres Nährwerts verbessert. Diese Pflanzen werden getestet, um nützliche Eigenschaften beizubehalten, um sicherzustellen, dass ihr Nährwert im Laufe der Zeit erhalten und verbessert wird.
Das Klonen von Pflanzen ist ein kostspieliger Prozess, der qualifizierte Arbeitskräfte, moderne Technologie, spezielle Ausrüstung und einzigartige Hilfsmittel wie Wurzelhormone, spezielle Wachstumsmedien zur Erleichterung der Gewebekultur und spezielle Wurzelstöcke für die Transplantation erfordert. Durch das Klonen entstehen auch genetisch identische Pflanzen, wodurch die Pflanzenvielfalt verloren geht und bei Krankheitsausbrüchen wahrscheinlich alle geklonten Pflanzen betroffen sind. Durch Klonen reproduzierte Pflanzen haben auch eine kurze Lebensdauer im Vergleich zu denen, die durch den normalen Düngungsprozess erzeugt werden.