Laut Boundless, einem Cloud-basierten Lehrbuch und Lehrmittel, ist das Hauptmerkmal von unvollkommenen Pilzen und Flechten ein nicht klassifizierbarer oder fehlender sexueller Lebenszyklus. Aus diesem Grund werden sie als . betrachtet "unvollkommen." Typischerweise leben unvollkommene Flechten und Pilze auch an Land und haben ein Myzel oder eine Masse von Hyphen, die ein flockiges, schimmelartiges Aussehen haben.
Unvollkommene Pilze und Flechten sind im Stamm Deuteromycota; das bedeutet, dass sie nicht die Geschlechtsstrukturen haben, die normalerweise zur Klassifizierung von Pilzen benötigt werden. Laut der University of Hawaii ist ein asexuelles oder nicht klassifizierbares Sexualstadium einer der Hauptgründe für die Klassifizierung bestimmter Pilze und Flechten als unvollkommen. Sobald das sexuelle Stadium bestimmt ist, werden die Pilze neu klassifiziert und in die entsprechende Unterteilung eingeordnet.
Unvollkommene Pilze sind auch polyphyletisch, was darauf hindeutet, dass sie mehrere Vorfahren haben. Mit anderen Worten, unvollkommene Pilze und Flechten sind im Allgemeinen eine Mischung aus mehreren Pilzen. Dies deutet darauf hin, dass es schwierig ist zu bestimmen, von welchen Pilzen sie ursprünglich stammen, weil ihre genetische Information rekombiniert wurde. Schließlich produzieren unvollkommene Pilze und Flechten ohne die Hilfe eines Sporangiums asexuelle Sporen. Sie produzieren Konidiosporen oder Konidien, das sind die einzelligen Sporen, die den Pilzen helfen, sich zu vermehren.