Pilzähnliche Protisten weisen Merkmale sowohl einzelliger als auch mehrzelliger Lebensformen auf. Sie werden oft auf zerfallendem organischem Material gefunden und vermehren sich, indem sie Sporen bilden. Dazu gehören Schleimpilze und Wasserpilze. Schleimpilze werden weiter in zelluläre Schleimpilze und plasmodiale Schleimpilze unterteilt.
Zelluläre Schleimpilze leben in Süßwasser und feuchtem Boden und verbringen einen Großteil ihrer Zeit in einer amöbenähnlichen Fütterungsphase. Bei Nahrungsknappheit verklumpen viele einzelne Zellen schneckenförmig und bewegen sich koordiniert. Sobald sie zur Fortpflanzung bereit sind, hört diese schneckenähnliche Form auf, sich zu bewegen und verwandelt sich in einen Fruchtkörper, der Sporen freisetzt.
Plasmodiale Schleimpilze leben nicht als separate Zellen, sondern als große einzelne Zytoplasmamasse mit vielen Kernen, die als Plasmodium bekannt sind. Sie setzen Sporen frei, um in Zeiten zu überleben, in denen ein Plasmodium dies nicht konnte. Plasmodiale Schleimpilze kriechen langsam von Ort zu Ort und ernähren sich von verwesendem Material.
Wasserpilze bilden verzweigte Filamentstrukturen mit Zellwänden aus Zellulose. Einige Arten ernähren sich von toten Pflanzen und Tieren, aber viele sind Parasiten. Aquatische Arten parasitieren oft Fische und wachsen auf ihren Kiemen. Landarten parasitieren oft Pflanzen. Ein Wasserschimmel war für die irische Kartoffel-Hungernot verantwortlich.
