Es gibt nur einen dokumentierten Raubvogel von Smaragdbaumboas, den Guiana-Schopfadler. Viele andere Raubvögel, wie der Harpyie, sind jedoch sicherlich in der Lage, die Boas zu töten und zu fressen. Darüber hinaus fressen große Katzen wie Jaguare wahrscheinlich Smaragdbaumboas, wenn sie sie finden.
Die wichtigsten Möglichkeiten, wie sich Smaragdbaumboas vor Raubtieren schützen, sind ihre unglaubliche Tarnung, baumbewohnende Gewohnheiten und ihr nächtlicher Aktivitätszyklus. Smaragdbaumboas sind tiefgrün, weisen aber auch verschiedene weiße, gelbe, graue und blaue Markierungen auf. Die grüne Färbung hilft den Schlangen, sich in das grüne Laub des Regenwaldes einzufügen, während die farbigen Markierungen helfen, die Umrisse der Schlangen aufzubrechen. Smaragdbaumboas verbringen den größten Teil des Tages mit Schlafen, während sie sich um einen Ast gewickelt haben, und wachen nach Einbruch der Dunkelheit auf, um zu jagen. Wenn ein Raubtier angegriffen wird, klammern sich Smaragdbaumboas hartnäckig an ihren Ast und schlagen kräftig zu.
Smaragdbaumboas haben ein ausreichendes Sehvermögen, aber die primäre Möglichkeit, Raubtiere zu erkennen, ist der Geruch. Mit ihren gespaltenen Zungen können Smaragdbaumboas Raubtiere riechen, noch bevor sie nahe genug sind, um gesehen zu werden. Smaragdbaumboas nutzen ihren ausgezeichneten Geruchssinn auch, um Beutetiere wie Nagetiere und Frösche zu orten, aufzuspüren und zu fangen.