Biotische Faktoren von Flüssen umfassen Insekten, Fische, Periphyton und benthische Makroinvertebraten, die in funktionelle Nahrungsgruppen wie Häcksler und Grasfresser eingeteilt werden. Diese lebenden Organismen bilden einige der wichtigsten biotischen Faktoren in jedem Flussökosystem , laut Naturerziehung.
Das Flussökosystem bietet ein dynamisches Umfeld für die biotische Vielfalt. Aquatische Ökologen konzentrieren sich bei ihren Untersuchungen zu Flussökosystemen aufgrund ihrer Häufigkeit und Komplexität tendenziell auf benthische Makroinvertebraten. Zu den vier funktionellen Fütterungsgruppen benthischer Makroinvertebraten gehören Schredder, die jeder verlässt; Kollektoren, die feinteilige organische Stoffe verbrauchen; Weidetiere, die sich von Periphyton ernähren; und Raubtiere. Der physische Lebensraum des Flusses selbst bestimmt, welche dieser vier Organismenkategorien am ausgeprägtesten ist. Kleine Bäche mit gemäßigten Temperaturen bieten zum Beispiel die idealen Bedingungen für das Gedeihen von Häckslern und Sammlern, während sich in größeren Bächen öffnende Baumkronen den Grasfressern einen besseren Zugang zu ihrer Hauptnahrungsquelle Periphyton ermöglichen.
Fische leisten auch einen wichtigen Beitrag zum Flussökosystem, insbesondere anadrome Fische, die die meiste Zeit ihres Lebens in einer Meeresumwelt verbringen und zur Fortpflanzung flussaufwärts reisen. Diese Fische bringen Meeresnährstoffe in die Umwelt, was mindestens ein Experiment mit einem erhöhten Insektenvorkommen im Flussökosystem in Verbindung gebracht hat, wie von Nature Education angegeben.
