Die beiden Purine in der DNA sind Adenin und Guanin. Innerhalb der DNA-Struktur sind Purine mit komplementären Pyrimidinbasen gepaart und bilden Basenpaare, die durch Wasserstoffbrücken verbunden sind. Diese beiden Purine kommen auch in RNA vor.
Die chemische Hauptstruktur von Purinen besteht aus einem sechsgliedrigen Ring aus Kohlenstoff und Stickstoff, der mit einem fünfgliedrigen Ring aus den gleichen Elementen verschmolzen ist. Im Gegensatz zu Purinen haben Pyrimidine eine Einzelringstruktur. Um Basenpaare zu bilden, paart sich Adenin, ein Sechs-Aminopurin, mit Thymin über zwei Wasserstoffbrücken. Guanin, ein Zwei-Amino-Sechs-Oxy-Purin, verbindet sich mit Cytosin durch die Wasserstoffbrücken. In der RNA ist Uracil die Pyrimidinbase, die sich mit Adenin anstelle von Thyamin paart.