Einige Beispiele für einfache Proteine sind Histone, Globuline, Gluteline, Albuminoide und Albumine. Wenn diese Proteine durch den Hydrolyseprozess mit Wasser chemisch abgebaut werden, zerfallen sie normalerweise nur in Aminosäuren. Gelegentlich werden auch kleine Kohlenhydratverbindungen gefunden.
Histone sind die Proteine, die die DNA beim Kondensieren unterstützen, damit sie in Form von Chromosomen in den Zellkern passen kann. Bestimmte Histone dienen als spulenartige Strukturen, um die sich die DNA windet. Diese Proteine haben eine positive Ladung, wodurch sie von der negativ geladenen DNA angezogen werden können.
Globuline sind einfache Proteine, die aus Antikörpern, sogenannten Gammaglobulinen, Enzymen und Transportproteinen bestehen. Niedrige Globulinspiegel bei Bluttests werden mit Erkrankungen wie Nephrose, Leberfunktionsstörungen und akuter hämolytischer Anämie in Verbindung gebracht. Umgekehrt können erhöhte Globulinspiegel auf eine Vielzahl von Erkrankungen hinweisen, darunter parasitäre Infektionen, rheumatoide Arthritis, Nierenfunktionsstörungen, Leukämie und einige bakterielle und virale Infektionen.
Im Gegensatz zu einfachen Proteinen enthalten konjugierte Proteine sowohl Aminosäuren als auch Nichtproteinkomponenten. Nukleoproteine, Phosphoproteine, Lecithoproteine und Glykoproteine sind einige Beispiele für konjugierte Proteine. Inzwischen wird ein abgeleitetes Protein durch die physikalische oder chemische Veränderung eines einfachen oder eines konjugierten Proteins gebildet. Peptide und denaturierte Proteine fallen unter diese Kategorie abgeleiteter Proteine.