Die Basalganglien spielen eine Rolle bei einer Reihe von Funktionen im Gehirn, einschließlich der unwillkürlichen motorischen Kontrolle und einiger kognitiver Funktionen. Die genaue Funktion der Basalganglien wird noch untersucht und beobachtet , obwohl festgestellt wurde, dass das Gebiet eine Rolle bei Krankheiten spielt, einschließlich der Parkinson-Krankheit und der Huntington-Krankheit. Beide Erkrankungen betreffen die motorischen Kontrollbereiche des Gehirns.
Neben der Unterstützung der Basalganglien bei den Bewegungen des Körpers spielt es auch eine Rolle bei einer Reihe von kognitiven Prozessen. Das Gebiet hat eine Reihe von Bahnen, die nicht nur durch die Basalganglien, sondern auch durch den präfrontalen Assoziationskortex und den limbischen Kortex verlaufen. Studien zeigen, dass diese Schleifen und Verbindungen eine Rolle bei der Auswahl oder Aktivierung einer Reihe von kognitiven, emotionalen und exekutiven Funktionen im Gehirn spielen.
Dieser Bereich des Gehirns, der sich an der Basis des Vorderhirns in der Nähe des Thalamus befindet, spielt auch eine wichtige Rolle bei der Gedächtnisfunktion im menschlichen Gehirn. Menschen mit Störungen dieses Teils des Gehirns haben Probleme mit dem Auswendiglernen und Wahrscheinlichkeitsaufgaben. Da die Basalganglien mit der Großhirnrinde, dem Thalamus und dem Hirnstamm verbunden sind, spielt der Bereich eine Rolle bei zahlreichen Funktionen im Körper, von denen viele noch erforscht werden.
