Alle Affen gehören zum Königreich Animalia, dem Phylum Chordata, der Klasse Mammalia und den Ordensprimaten. In den Ordensprimaten gibt es zwei Affenfamilien. Dies sind die Cebidae oder Neuweltaffen und die Cercopithecidae oder Altweltaffen. Es gibt mehrere Affengattungen in jeder dieser Familien und viele Arten innerhalb jeder Gattung.
Ob ein Affe als Art der Alten Welt oder der Neuen Welt klassifiziert wird, hängt von mehreren Merkmalen ab. Dazu gehören die Qualität des Schwanzes, die Struktur der Nase und die Zahnanordnung. Neuweltaffen neigen dazu, Greifschwänze oder keinen Schwanz zu haben, während Altweltaffen Schwänze haben, aber sie sind nie Greifschwänze. Affen der Alten Welt haben acht statt zwölf Prämolaren und ihre Nasenlöcher zeigen nach unten, während Affen der Neuen Welt Nasenlöcher haben, die nach oben zeigen.
Gemeinsame Arten von Cebidae-Affen sind der Kapuzineraffen und der goldene Löwenäffchen. Kapuzineraffen fallen in mehrere Gattungen. Zur Gattung Sapajus gehören unter anderem der großköpfige Kapuziner und der Inselkapuziner Margarita. Die Gattung Cebus umfasst die Weißstirn- und Weißgesichtskapuziner. Der Goldene Löwenäffchen gehört zur Gattung Leontopithecus, in der es vier verschiedene, aber ähnliche Arten von Löwenäffchen gibt. Zu den gängigen Affengattungen der Alten Welt gehören Chlorocebus, zu dem die Grünen Affenarten gehören, und Macaca, zu denen viele Makakenarten gehören.
