Der amerikanische Alligator, den Wissenschaftlern als Alligator mississippiensis bekannt, steht an der Spitze der Nahrungskette. Amerikanische Alligatoren, die als Spitzenprädatoren bezeichnet werden, ernähren sich von praktisch jeder anderen Kreatur, die ihren Lebensraum teilt, aber sie fürchten nichts außer Menschen und größeren Alligatoren. Ihre Jungen sind jedoch nicht so sicher und viele Baby-Alligatoren werden von einer Vielzahl von Wasserraubtieren gefressen.
Fische und Schildkröten sind für die meisten Alligatoren die wichtigste Beute, aber sie sind keine wählerischen Esser. Andere häufige Beutetiere sind Schlangen, Frösche, Kröten, Salamander, Vögel, Eidechsen, Biber, Waschbären, Nutria, Ratten, Krebstiere, Weichtiere, Insekten und kleinere Alligatoren. Junge Alligatoren ernähren sich von kleineren Beutetieren, darunter Insekten, Frösche und Fische. Alligatoren jeden Alters passen sich an lokale Nahrungsquellen an, sind jedoch ausschließlich Fleischfresser und fressen keine Vegetation.
Watvögel, Schlangen, große Fische, Schildkröten, Waschbären, Füchse und größere Alligatoren jagen junge Alligatoren. Während sie wachsen, fügen junge Alligatoren ihrer Liste akzeptabler Nahrung immer größere Beutetiere hinzu. Gleichzeitig fürchten Alligatoren mit zunehmendem Wachstum weniger Raubtiere.
Alligatoren sind ein wichtiger Bestandteil von Süßwasserökosystemen, da sie dazu beitragen, das Gleichgewicht zwischen den Kleintierpopulationen aufrechtzuerhalten. Außerdem legen Schildkröten und einige andere Tiere ihre Eier in Alligatornestern ab.