Der Unterschied zwischen Epistemologie und Ontologie ist zum Teil das Fach, das von jedem studiert wird. In der Ontologie werden das Studium des Seins oder der Existenz und die Fragen, welche Arten von Entitäten existieren, untersucht. In der Erkenntnistheorie werden das Studium des Wissens und der Art und Weise, wie wir wissen, und Fragen darüber untersucht, was Wissen ist und wie Wissen möglich ist.
Sowohl Ontologie als auch Erkenntnistheorie sind Zweige der Philosophie. Ontologie ist eine Art Metaphysik. Die Erkenntnistheorie beinhaltet oft eine Debatte zwischen Empirismus und Rationalismus, in der ersterer behauptet, dass Wissen nur durch Erfahrung erlangt werden kann, während letzterer glaubt, dass Wissen allein durch Vernunft erworben werden kann.
Die Ontologie beschäftigt sich mit dem, was wahr ist, und andererseits umfasst die Erkenntnistheorie die verschiedenen Methoden, um diese Wahrheit herauszufinden. Mit anderen Worten, bei der Ontologie geht es um die Natur der Realität und bei der Epistemologie um die Beziehung zwischen dem Forscher oder einer anderen Person und dieser Realität.
Viele Probleme haben mehrere, oft widersprüchliche Ontologien oder Theorien darüber, was wahr ist, sowie verschiedene Epistemologien oder Möglichkeiten, Dinge herauszufinden. Wissenschaft und Religion haben zum Beispiel gegensätzliche Ontologien und Erkenntnistheorien über die Existenz Gottes und die Ursprünge des Universums.