Der Belgische Malinois ist eine völlig andere Hunderasse als der Deutsche Schäferhund, aber aufgrund ihres ähnlichen Aussehens wird manchmal angenommen, dass sie gleich sind. Malinois und Deutsche Schäferhunde haben eine Reihe von Unterschieden: Herkunft, Fellart, mögliche Farben und Fellgewohnheiten.
Der grundlegendste Unterschied zwischen den beiden Rassen ist ihre Herkunft, da jede in ihrem Namen aus dem Land stammt. Während die beiden Rassen manchmal ähnlich aussehen, gibt es subtile Unterschiede in ihrem Aussehen. Malinois haben ein feines oder drahtiges Fell, während Deutsche Schäferhunde ein mittleres Fell haben. Beide Rassen können schwarz oder braun und schwarz sein, aber Malinois können auch grau sein, während Deutsche Schäferhunde weiß sein können. Außerdem verliert Malinois nur saisonal, während ein Deutscher Schäferhund das ganze Jahr über kontinuierlich verliert.
Belgische Malinois werden fast ausschließlich als Hütehunde gezüchtet, während Deutsche Schäferhunde entweder Hüte- oder Arbeitshunde sein können. Deutsche Schäferhunde haben eine etwas geringere minimale Lebenserwartung, aber die gleiche maximale Lebenserwartung von 13 Jahren. Deutsche Schäferhunde haben außerdem sowohl ein niedrigeres Mindest- als auch ein höheres Höchstgewicht. Während die Hunde ein sehr ähnliches allgemeines Temperament haben, neigen belgische Malinois nicht sehr dazu, beschützerisch zu sein, während Deutsche Schäferhunde nicht dazu neigen, ansprechbar oder unabhängig zu sein.