Amphibien verwenden eine Reihe verschiedener Atmungsmethoden, wobei Jungtiere Kiemen und Haut verwenden, bevor sie sich in Erwachsene verwandeln, die Lunge und Haut verwenden. Alle Amphibien halten ihre Haut immer zumindest etwas feucht, um Gasaustausch ermöglichen. Ihre dünne Haut hat darunter eine Reihe von Blutgefäßen, um die absorbierten Gase zu nutzen. Verschiedene Arten, sogar in derselben Umgebung, unterscheiden sich in ihren Atmungsorganen.
Die meisten Amphibien beginnen ihr Leben als Wassertiere. Die meisten Amphibienkiemen sind eigentlich äußere Strukturen, die vollständig freigelegt sind, und nicht die besser geschützten Kiemen von Fischen. Einige Salamander wechseln nie von solchen Kiemen und bleiben ihr ganzes Leben lang Wassertiere mit Kiemen. Umgekehrt werden eine Reihe von Amphibien als Landtiere mit Lungen statt Kiemen geboren. Andere Arten haben weder Lungen noch Kiemen und sind für den Gasaustausch ausschließlich auf ihre Haut angewiesen.
Amphibienlungen, sofern vorhanden, unterscheiden sich stark von Säugetier- oder anderen fortgeschritteneren Lungen. Die Lunge von Säugetieren hat eine schwammartige Struktur, die ihre Oberfläche drastisch vergrößert und einen weitaus effizienteren Gasaustausch ermöglicht. Amphibienlungen sind viel einfachere, sackartige Organe. Da sie kaltblütig sind, ist der Energiebedarf von Amphibien im Allgemeinen geringer als der von Säugetieren und sie neigen dazu, ihre Lungen nur gelegentlich zu verbrauchen.