Der Präriehund ist vor allem durch den Verlust von Lebensraum durch die städtische und landwirtschaftliche Entwicklung gefährdet. Es gibt mehrere Arten von Präriehunden, von denen jede aus unterschiedlichen Gründen gefährdet ist, einschließlich der Pest.
Der Schwarzschwanz-Präriehund ist seit 2014 fast ausgestorben. Er wurde hauptsächlich deshalb in diesen Zustand getrieben, weil er nicht gegen die Pest immun ist. Gunnisons Präriehund ist von Pest, Landentwicklung und Gas- und Ölbohrungen bedroht. Der Verlust von Lebensraum durch die Landwirtschaft hat den mexikanischen Präriehund gefährdet. Der Präriehund von Utah ist durch Viehweiden, Pest und Lebensraumverlust bedroht. Ab 2010 verweigerte der U.S. Fish & Wildlife Service den Schutz von Weißschwanz-Präriehunden gemäß dem Endangered Species Act.
