Die Hauptursache für die Gefährdung von Honigbienen sind Parasiten, darunter Luftröhren- und Varroamilben, die in den 1980er Jahren in Nordamerika eingeschleppt wurden. Diese Parasiten verursachen Krankheiten, die für die Bienenvölker schädlich sein können, z. B. eine Krankheit, die dazu führt, dass neu aufgezogene Bienen mit missgebildeten Flügeln und Flugunfähigkeit auftauchen.
Obwohl Milbenbekämpfungsmittel entwickelt wurden, die gegen diese Milben wirksam sind, beginnen die Milben ab 2015 eine Resistenz gegen die Chemikalien zu entwickeln. Wissenschaftler entwickeln einen milbenresistenten Honigbienenstamm in der Hoffnung, Bienen in den betroffenen Gebieten wieder zu besiedeln.
Andere Ursachen für den Rückgang der Bienenpopulation sind die Abholzung und Zerstörung einheimischer Lebensräume durch den Bau von Parkplätzen, Einkaufszentren und anderen Strukturen.
