Die Proteinsynthese unterscheidet sich bei Prokaryoten und Eukaryoten aufgrund von Variationen des Initiationsprozesses und der Methode der Informationsübersetzung, die von den Zellen durchgeführt wird. Eukaryoten sind typischerweise komplexer als Prokaryoten und führen eine kompliziertere Form der Proteinsynthese.
Die Proteinsynthese in Prokaryoten und Eukaryoten beinhaltet die Verwendung eines genetischen Materials, das als mRNA bekannt ist, das Informationen kopiert, die für die Bildung eines neuen Proteins aus Genen erforderlich sind, und es in ein Zellorganell, das als Ribosom bekannt ist, transportiert. Wenn die mRNA das Ribosom erreicht, beginnt die erste Stufe der Proteinsynthese, die als Initiation bekannt ist, in der das Ribosom versucht, die mRNA richtig zu translatieren, um das gewünschte Protein zu erzeugen.
Die Proteinsynthese erfordert, dass sich das Ribosom an eine Kette von Aminosäuren und Basen bindet, die in der mRNA als Codon bekannt sind. Dadurch kann die mRNA mit Transfer-Ribonukleinsäuren, bekannt als tRNA, übereinstimmen, um den Prozess der Proteinsynthese fortzusetzen. Die Lage des Codons, das verwendet wird, um die mRNA zu translatieren und ein neues Protein zu synthetisieren, unterscheidet sich zwischen Eukaryoten und Prokaryoten, was zu zwei unterschiedlich vorkommenden Sequenzen führt, die für die Proteinsynthese notwendig sind. Wenn die Proteinsynthese in beiden Zelltypen abgeschlossen ist, verursachen spezifische Codons, die als Stoppcodons bekannt sind, eine Reaktion im Ribosom, die die Synthesesequenz beendet und die Freisetzung des neu geschaffenen Proteins in die Zelle ermöglicht.