Java-Tiger starben hauptsächlich aus, weil ihre natürlichen Lebensräume zerstört und zum Nutzen einer schnell wachsenden menschlichen Bevölkerung kultiviert wurden, so About.com. Sie wurden gejagt und vergiftet und galten als Schädlinge sein, weil sie Anfang des 19. Jahrhunderts auf Java verbreitet waren. Es gab auch einen erhöhten Wettbewerb um Beute, als Wildhunde auf Java eingeführt wurden.
Nach dem Zweiten Weltkrieg wurden viele natürliche Wälder zerstört, um Plantagen anzulegen, die für Teak, Kaffee und Kautschuk verwendet wurden. Diese Fragmentierung der Wälder führte dazu, dass die natürlichen Lebensräume nicht mehr geeignet waren, das Tierleben zu unterstützen. Die wichtigste Beuteart des Java-Tigers, der Rusahirsch, wurde in den 1960er Jahren in vielen Wäldern und Reservaten von Krankheiten heimgesucht, was zum Untergang des Tigers beitrug.
Obwohl es seitdem unbestätigte Sichtungen gab, war die letzte dokumentierte Javan-Tigersichtung 1972, und die IUCN erklärte den Javan-Tiger 2003 offiziell für ausgestorben. Gegen Ende der Existenz des Javan-Tigers wurden sie auf die Außenbezirke der Insel Java und der meistbewohnte Mount Betin, der höchste und abgelegenste Teil der Insel.
Obwohl der Java-Tiger größer als der Bali-Tiger war, war er eine relativ kleine Unterart der asiatischen Festlandtiger.
