Weibchen kümmern sich bei der Geburt um ihre Jungen, indem sie sie in einem Membranbeutel halten und stillen. Für einige Zeit nach der Geburt tragen sie ihre kleinen Babys möglicherweise beim Füttern mit sich, aber die Mütter lassen sie später im Schlafplatz und kehren häufig zurück, um sie zu füttern.
Weibliche Fledermäuse haben normalerweise nur ein Baby auf einmal, möglicherweise weil sie auch während der Schwangerschaft fliegen und füttern müssen. Wenn es Zeit für die Geburt ist, hängen die Weibchen einiger Arten mit dem Kopf nach oben an ihren Daumen und fangen ihre Jungen in einer Schwanzhaut, während andere Arten mit dem Kopf nach unten hängen und das Baby mit ihren Flügeln fangen. Die Fledermauswelpen werden mit geschlossenen Augen und haarlos geboren und klammern sich sofort mit ihren scharfen Krallen und manchmal mit den Zähnen an ihre Mütter.
Je nach Größe der Fledermausart können sich Fledermauswelpen einige Tage bis einige Wochen lang an ihre Mütter klammern, während sie fliegen und fressen. Wenn sie zu schwer zum Tragen sind, lassen sie die Mütter sie während der Nahrungssuche an einer Wand, einem Ast, einem Dach einer Höhle oder einem anderen Unterschlupf festhalten. Die Sterblichkeitsrate von Fledermauswelpen ist hoch, da einige Babyfledermäuse von ihren Sitzstangen fallen und nicht wieder hochklettern können.
Je nach Fledermausart entwickeln junge Fledermäuse ihre Flügel vollständig aus und erlangen die Flugfähigkeit innerhalb von drei Wochen bis vier Monaten. Wenn sie dies tun, sind sie dafür verantwortlich, ihr eigenes Essen zu jagen.
