Jaguare sind aufgrund der Zerstörung ihres Lebensraums, der Jagd und der Verfolgung durch Viehzüchter gefährdet. Sie sind nur in bestimmten Teilen ihres Verbreitungsgebiets gefährdet, beispielsweise in den Vereinigten Staaten, Mexiko und El Salvador. Sie haben einige stabile Populationen, aber die menschliche Entwicklung bedroht sie überall.
Jaguare bevorzugen tropische feuchte Tieflandwälder, kommen aber auch in Sümpfen, Buschland und anderen Umgebungen vor. Sie sind wichtige Mitglieder ihrer Ökosysteme und Spitzenprädatoren in ihrem gesamten Lebensraum. Sie sind sehr weit verbreitet, besetzen aber 2014 nur 46 Prozent ihres historischen Verbreitungsgebiets. Ihre einzigen großen Raubtiere sind Menschen, obwohl junge Jaguare anfällig für andere Raubtiere sind und zum Schutz vollständig auf ihre Mütter angewiesen sind.
