Das Schwarzfußfrettchen ist gefährdet, da die Hauptnahrungsquelle, die Präriehunde, aufgrund des Verlusts des Lebensraums zurückgeht. Eine Schwarzfußfrettchenkolonie benötigt mindestens 10.000 Acre Präriehunde Kolonien, um zu überleben. Wenn die Prärie in Ackerland umgewandelt wird, nimmt die Population der Präriehunde ab, was die Frettchenpopulation mit sich nimmt.
1986 lebten nur noch 18 Schwarzfußfrettchen in freier Wildbahn, und Zuchtprogramme in Gefangenschaft bewahrten dieses Tier vor dem Aussterben. Das Frettchen wurde langsam wieder in die Wildnis ausgewildert, aber eine erfolgreiche Wiederansiedlung erfordert mindestens 20.000 Hektar Präriehundekolonien. Das Frettchen verbreitet sich an mehr als 20 Standorten in den USA, Mexiko und Kanada mit einer Wildpopulation von 500 (Stand 2013).
Das Schwarzfußfrettchen ist ein nachtaktives Tier, das den größten Teil seines Lebens unter der Erde verbringt. Es frisst, schläft und paart sich in seinem Bau und geht nur noch, um Präriehunde zu jagen. Wenn sich das Frettchen fortpflanzt, hat das Weibchen eine Wurfgröße zwischen drei und vier Jungen. Die Kits bleiben die ersten Wochen ihres Lebens unter der Erde. Sobald sie 2 Monate alt sind, begleiten sie ihre Mutter auf Jagdausflügen. Zu diesem Zeitpunkt leben die Kits in separaten Höhlen. Wenn die Kits 5 Monate alt sind, sind sie völlig unabhängig.
