Nicht alle Wasserschildkröten können unter Wasser atmen, aber einige haben Methoden entwickelt, um unter Wasser Sauerstoff zu bekommen. Einige nehmen Wasser durch Nase oder Mund auf und bekommen Sauerstoff durch den Rachen, während andere aufnehmen Wasser durch ihre Analöffnungen, so die Oceanic Resource Foundation.
Sauerstoff kann durch die Haut im Rachenbereich oder durch spezielle Säcke im Analbereich aufgenommen werden. Es gibt auch mindestens eine Art mit Kiemenstrukturen im Analbereich, die bei der Atmung unter Wasser helfen. Schildkröten können den Atem über einen längeren Zeitraum anhalten, bei einigen Arten bis zu drei Stunden, und können besser mit Kohlendioxid umgehen, wodurch sie weniger oft atmen müssen.
