Die Pilger in der Plymouth Bay Colony waren Calvinisten und puritanische Separatisten, während die Puritaner in der Massachusetts Bay Colony entschlossen waren, die anglikanische Kirche von innen heraus zu reformieren. Obwohl beide Protestanten und Puritaner waren, hatten sie unterschiedliche Ziele und Überzeugungen.
Die meisten Puritaner wollten die Praktiken der anglikanischen Kirche reinigen und zogen es vor, sie von innen heraus zu reformieren, um alle Makel der katholischen Anbetung zu beseitigen. Viele dieser Puritaner gründeten die Massachusetts Bay Colony, um ihre Stadt auf einem Hügel zu bauen, eine Kirche, die andere Puritaner als Vorbild sehen könnten. Die Pilger hatten jedoch im späten 16. Jahrhundert festgestellt, dass die anglikanische Kirche nicht mehr reformierbar war. Daher hatten sie sich vollständig von der Kirche getrennt, viele von ihnen zogen nach Holland, bevor sie in die amerikanischen Kolonien auswanderten.
Obwohl diese Unterschiede geringfügig erscheinen, war es für die Puritaner von Massachusetts einfacher, finanzielle Mittel und die Zustimmung und den Schutz des britischen Throns zu erhalten als für die Pilger. Darüber hinaus waren die Puritaner von Massachusetts insgesamt eine gebildetere und wohlhabendere Gruppe als die Pilger, die hauptsächlich Handwerker und Bauern waren. Dies führte im Laufe der Zeit zu mehr Wohlstand und einem viel schnelleren Wachstum für den Raum Boston-Salem. 1691 fusionierte die noch kleine Kolonie Plymouth mit der Kolonie Massachusetts Bay zur Provinz Massachusetts Bay.