Freie Aminosäuren enthalten keine Peptidbindungen, da sie die Monomerbausteine von Proteinen sind. Wie von Dr. John W. Kimball erklärt, bilden sich Peptidbindungen zwischen zwei Aminosäuren, wodurch lange Polypeptidketten entstehen. Proteine bestehen aus einer oder mehreren dieser Polypeptidketten.
Zwanzig verschiedene Aminosäuren werden verwendet, um Proteine zu synthetisieren. Aminosäuren bestehen aus einem zentralen Alpha-Kohlenstoffatom, Wasserstoffatom, Carboxylgruppe, Aminogruppe und einer funktionellen Gruppe, die die Art der Aminosäure bestimmt. Kimball erklärt, dass während der Proteinsynthese eine kovalent verknüpfte Peptidbindung zwischen der Carboxylgruppe einer Aminosäure und der Aminogruppe der nächsten Aminosäure entsteht.