Nachts beenden Eichhörnchen ihre Aktivitäten, indem sie sich in Nester zurückziehen, die hauptsächlich in Bäumen gebaut sind. Wie Vögel bauen die meisten Eichhörnchen Nester, die ihnen als Zuhause dienen, in denen sie ihre Jungen aufziehen und ausruhen. Viele bauen ihre Behausungen auf Ästen, obwohl einige in Baumhöhlen hoch in den Baumstämmen Unterschlupf suchen.
Einige Eichhörnchen, wie Eulen und größere Vögel, suchen bei Einbruch der Dunkelheit Schutz in Baumhöhlen oder Höhlen. Mehrere Arten, wie Grau-, Fuchs- und Eichhörnchen, ruhen am ehesten auf diese Weise. Diese Eichhörnchen können ihre Behausung komfortabel gestalten, indem sie weiches Einstreumaterial wie Blätter und Moos hinzufügen. Eichhörnchen können während der wärmeren Monate im Frühjahr und Sommer temporäre Nester in Ästen bauen und Höhlen für den Winterschlaf reservieren. Kurzfristige saisonale Nester, sogenannte Drays, ermöglichen Eichhörnchen zu schlafen und ihre Jungen aufzuziehen. Diese Schlafräume sind wie Höhlen oft mit Blättern und Zweigen befestigt und befinden sich in Richtung des Stammteils größerer Bäume. Während fast alle Eichhörnchen im Winter Winterschlaf halten, überwintern nur diejenigen, die an heißen Orten leben, im Sommer. Anstatt in Bäumen zu nisten, graben Eichhörnchen jedoch Höhlen unter der Erdoberfläche, um den sengenden Sommerstrahlen zu entkommen.
