Laut der Reptile Database hat die Mehrheit der Schlangen 36 Chromosomenpaare. Zwanzig der Chromosomen werden als Mikrochromosomen bezeichnet, während der Rest als Makrochromosomen bezeichnet wird. Der Begriff "Schlangen" bezieht sich jedoch auf über 3.400 verschiedene Arten und viele haben ihren Karyotyp nicht untersucht, so dass einige Variationen existieren können.
Im Gegensatz zu vielen Reptilien wie Krokodilen, Schildkröten und einigen Geckos wird das Geschlecht von Schlangen durch ihre Chromosomen bestimmt und nicht durch die Umweltbedingungen, die die sich entwickelnden Eier umgeben. Schlangen zeigen jedoch das umgekehrte Muster als das, was von Menschen gezeigt wird. Während menschliche Männchen das heterogametische Geschlecht sind und ein X- und ein Y-Chromosom aufweisen, sind weibliche Schlangen das heterogametische Geschlecht und haben ein Z- und W-Chromosom.
