Seelöwen werden hauptsächlich von Schwertwalen und Haien bedroht und versuchen, diesen Raubtieren mit wenigen natürlichen Abwehrmechanismen zu entkommen, indem sie so schnell wie möglich aus dem Wasser und an Land gelangen. Seelöwen sind schnellere Schwimmer als ihre beiden natürlichen Feinde und können ihnen, wenn sie gesund, ausgewachsen und sich der Bedrohung bewusst sind, mit Leichtigkeit ausweichen.
Für Seelöwen sind jedoch Menschen weitaus gefährlicher als Schwertwale und Haie. Menschen jagen Seelöwen für Nahrung, Speck, Öl und Pelz. Die Tiere werden auch getötet, um zu verhindern, dass sie mit Fischern konkurrieren, die nicht nur ihren Fang, sondern auch ihre Fischernetze vor den Schäden schützen wollen, die die Seelöwen anrichten. In den späten 1800er Jahren erlaubten die Regierungen den Menschen, Seelöwen gegen ein Kopfgeld zu töten, um die Bevölkerung zu kontrollieren.
Seelöwen haben keine Abwehrkräfte gegen Menschen und ihre Population nimmt nur aufgrund der Bemühungen von Naturschutzgruppen zu, die mit verschiedenen Regierungen zusammenarbeiten, um Gesetze zu ihrem Schutz zu erlassen. Diese Gesetze gelten jedoch nicht weltweit. In Bezug auf den Erhaltungszustand werden Seelöwen als gefährdet beschrieben, wobei Wiederauffüllungspläne erstellt und umgesetzt werden können. Seit 2014 schädigen Wechselwirkungen mit kommerziellen Fischfangaktivitäten, das Verfangen in Schutt und Netzen, Ölverschmutzungen und menschliche Störungen die Seelöwenpopulationen weiterhin.