Einige der schädlichsten Mikroorganismen für den Menschen sind Staphylococcus aureus, Escheria coli, Enterococcus faecium und Pseudomonas aeruginosa. Mikroorganismen, die Krankheiten verursachen, werden als Krankheitserreger bezeichnet.
Alle Bakterien, die meisten Protozoen und einige Pilze sind Mikroorganismen. Der Begriff „Mikroorganismen“ bezeichnet eine Lebensform, die für das menschliche Auge ohne Mikroskop nicht sichtbar ist. Diese können eine einzelne Zelle sein oder aus vielen Zellen bestehen. Es gibt Mikroorganismen in jeder Umgebung auf der Erde, aber es gibt mehr nützliche als schädliche Mikroorganismen. Gentechnik beinhaltet die Manipulation von Mikroorganismen, um in größeren Organismen spezifische Eigenschaften zu erzeugen.