Bartagame zeigen Krankheit durch Missbildungen, verkümmertes Wachstum, Krampfanfälle, Farbverlust, Lähmung, Atemnot, Schleimausfluss, Durchfall, Appetitlosigkeit und Gewichtsverlust. Einige dieser Symptome weisen auf genetische Mängel hin das kann nicht geändert werden, aber andere Bedingungen können geändert werden, indem man die Umgebung oder die Ernährung des Bartagamen anpasst.
Mangel an Vitamin D3 und Kalzium führt zu Missbildungen, Wachstumsstörungen und Krampfanfällen. Diese können gelöst werden, indem die Insekten bei jeder Fütterung mit Kalzium- und Vitamin-D-Ergänzungen bestäubt werden und das Aquarium der Eidechse richtig beleuchtet wird. Bartagamen sollten in 40 bis 55-Gallonen-Tanks mit Bildschirmabdeckungen untergebracht werden. Über dem Becken sollten Leuchtstofflampen angebracht werden, damit die Eidechse in ihrem Sonnenbereich ausreichend UV-Strahlung und Wärme bekommt. Der Farbverlust durch Beta-Carotin-Mangel wird durch die Fütterung der Eidechse mit frischem orangefarbenem und gelbem Gemüse wie Karotten gemildert. Hinterviertellähmung wird durch Überfütterung verursacht. Bartagamen sollten nur mit kleinen Insekten gefüttert werden und Insekten mit harten Exoskeletten wie Mehlwürmer sollten nur frisch gehäuteten Bartagamen verfüttert werden.
Obwohl einige Krankheiten zu Hause durch eine Änderung der Ernährung oder der Umgebungsbedingungen geheilt werden können, benötigen andere professionelle Hilfe. Wenn ein Bartagamen Atemprobleme wie Atemgeräusche und Schleim oder Magen-Darm-Erkrankungen wie Appetitlosigkeit und Durchfall zeigt, ist es am besten, ihn von einem Tierarzt behandeln zu lassen.