Pinguine haben eine Vielzahl von Raubtieren, darunter Robben, Schwertwale und Haie. Außerdem fressen Vögel, Füchse und Pumas Pinguine, wenn sich ihre Verbreitungsgebiete überschneiden. Entgegen der landläufigen Meinung sind Eisbären keine Raubtiere von Pinguinen, da Eisbären die nördliche Hemisphäre bewohnen, während Pinguine die südliche Hemisphäre bewohnen.
Unabhängig von der Art haben Pinguineier und -Küken viel mehr Raubtiere als Erwachsene. Die Eier werden von einer Vielzahl von Raubtieren gefressen, darunter Vögel und Ratten. Viele Vögel ernähren sich von Küken, insbesondere Arten wie Raubmöwen, Graubünden und Riesensturmvögel. Magellenische Pinguinjunge werden sogar von großen haarigen Gürteltieren gejagt. Einige Jungtiere fallen Schlangen, Krabben und anderen kleinen Raubtieren zum Opfer. Weiße Haie und Killerwale sind gut dokumentierte Raubtiere erwachsener Pinguine. Seeleoparden fressen selbst die größten Pinguinarten, während sich Pelz- und Weddellrobben auf etwas kleinere Arten konzentrieren. Seelöwen sind auch wichtige Raubtiere von Pinguinen.
Pinguine verteidigen sich vor allem durch ihre sozialen Gewohnheiten, ihre Schwimmfähigkeit und ihre gegensätzlichen Farbmuster. Gegenschattige Tiere sind dorsal dunkel und ventral hell. Die dunklen Farben tarnen sich bei Betrachtung von oben mit dem Ozean, während die hellen Farben bei Betrachtung von unten mit der Wasseroberfläche tarnen.
Pinguine ernähren sich hauptsächlich von Krill, Tintenfischen und kleinen Fischarten.