Geckos haben viele natürliche Feinde, von denen der wichtigste Schlangen sind. Auch große Spinnen, Vögel und andere Säugetiere fressen Geckos.
Viele Geckos können bei einem potentiellen Raubtier ihren Schwanz verlieren. Diese Selbstamputation oder Autonomie hilft dem Gecko bei der Flucht, da der abgetrennte Schwanz sich windet und das Raubtier ablenkt, so dass der Gecko entkommen kann. In den meisten Fällen wird dem Gecko ein Ersatzschwanz aus Knorpel wachsen. Nachdem die Gefahr abgeklungen ist, kehrt ein Gecko oft zu seinem abgetrennten Schwanz zurück und wenn er verfügbar ist, wird der Gecko ihn fressen. Geckos können auch Raubtieren entkommen, indem sie ihre Zehenpolster verwenden, die für das reibungslose Klettern vertikaler Oberflächen ausgelegt sind.