Der Zentralkanal sowie das gesamte Ventrikelsystem, zu dem er gehört, ist mit Ependym ausgekleidet, einer spezialisierten Epithelform mit neurologischen Zellen. Der Zentralkanal oder Ependymalkanal verläuft in Längsrichtung durch das Rückenmark und enthält Liquor.
Epithel ist ein spezialisiertes Gewebe, das die Innenseiten von Oberflächen und Hohlräumen im Körper auskleidet und keine Blutgefäße enthält. Das Ependym besteht aus Ependymzellen, die im Plexus choroideus, aber nicht im zentralen Kanal Liquor produzieren. Ependymazellen sind einfach säulenförmig bewimpert. Die Zilien, die die Oberflächen der Ependymzellen auskleiden, zirkulieren Liquor cerebrospinalis durch den Zentralkanal und das Zentralnervensystem. Mikrovilli bedecken auch ihre Oberflächen und absorbieren Gehirn-Rückenmarks-Flüssigkeit.
Die Flüssigkeitsfreisetzung über das Ependym wird durch enge, modifizierte Verbindungen zwischen Ependymzellen gesteuert. Diese Flüssigkeitsfreisetzung ermöglicht den Austausch von Liquor cerebrospinalis zwischen dem Ventrikelsystem und den neurologischen Geweben des Gehirns und des Rückenmarks. Die Basalmembran von Ependymzellen hat tentakelartige Fortsätze, die sich an Astrozyten, einer Form neurologischer Zellen, anheften. Die Zerebrospinalflüssigkeit schützt und polstert das Gehirn und das Rückenmark und trägt zur Aufrechterhaltung eines ordnungsgemäßen neurologischen Blutflusses bei. Es besteht zu 99 Prozent aus Wasser und enthält Plasmaproteine.