Der Rachen kommt direkt nach dem Mund in das Verdauungssystem des Regenwurms, wo er als Saugpumpe fungiert und Nahrungsbestandteile ansaugt. Er scheidet auch Schleim aus, um die Verdauung in späteren Stadien zu unterstützen. Nach dem Rachen folgen die Speiseröhre, die Kropf, der Muskelmagen und der Darm.
Wenn Nahrung vom Rachen in die Speiseröhre gelangt, setzt die Speiseröhre Kalziumkarbonat frei, um den Regenwurm von überschüssigem Kalzium zu befreien und den Säuregehalt der Nahrung zu kontrollieren. Das Futter gelangt dann in die Kultur, wo es für die spätere Verwendung gelagert wird. Sobald der Regenwurm fertig ist, gelangt die Nahrung zum Muskelmagen, der kleine mit der Nahrung aufgenommene Mineralpartikel in Kombination mit starken Muskelkontraktionen verwendet, um die Nahrung zu zerkleinern. Schließlich setzt der Darm Chemikalien frei, um die Verdauung zu unterstützen und alle freigesetzten Nährstoffe aufzunehmen. Die Chemikalien, die der Darm freisetzt, sind Enzyme, die alle in der Lage sind, Proteine, Kohlenhydrate oder Fette zu verdauen.
Ein Regenwurm hat einen Anus, um feste oder unverdaute Abfälle freizusetzen, aber er wird nicht für viele chemische, flüssige Abfälle verwendet. Stattdessen hat ein Regenwurm in vielen seiner Segmente mehrere Strukturen, die den menschlichen Nieren analog sind. Diese entfernen Giftstoffe und Stoffwechselabfälle aus dem Blut und geben die Abfälle aus mehreren Poren entlang der Körperseiten ab.