Die Invasion in der Schweinebucht brachte die Vereinigten Staaten in Verlegenheit, trieb einen Keil zwischen Präsident Kennedy und seine Geheimdienste und stärkte die Beziehung zwischen der Sowjetunion und Kuba. In der Folgezeit wechselten die Vereinigten Staaten zu verdecktere Methoden, um Fidel Castro abzusetzen, während die Sowjets begannen, Nachschub und Waffen nach Kuba zu schicken, um eine weitere Invasion zu verhindern. Dies führte schließlich 1962 zur Kubakrise.
In Bezug auf die Verluste war die Invasion in der Schweinebucht im Wesentlichen ein Unentschieden. Die kubanischen Streitkräfte erlitten 176 Tote, mindestens 500 Verwundete und etwa 4.000 Vermisste. Die CIA und ausländische Truppen erlitten 118 Tote, 360 Verwundete und 1.202 Gefangene. Mehrere der Gefangenen Kubas wurden später hingerichtet. Am Ende tauschte Kuba 1.113 Gefangene gegen etwa 53 Millionen Dollar an Wirtschaftshilfe. Castro ließ auch rund 1.000 Verwandte der Expatriates Kuba verlassen, um zu ihren Familienmitgliedern in die USA zu kommen.
Der Aufbau von Raketentruppen in Kuba nach der Schweinebucht löste im Oktober 1962 eine Pattsituation zwischen den Vereinigten Staaten und den Sowjets aus. Die Vereinigten Staaten entdeckten ballistische Mittelstrecken-Atomraketen im Inselstaat und forderten ihre Entfernung. Nach hitziger diplomatischer Rhetorik von beiden Seiten und einer Seeblockade Kubas einigten sich die Sowjets darauf, die Raketen im Austausch für die Zerlegung amerikanischer Raketen in der Türkei und das Versprechen, nie wieder eine Invasion Kubas zu versuchen, zu entfernen.
