J. J. Thompsons Atomtheorie beschrieb die innere Struktur von Atomen. Laut der Encyclopedia Brittanica besagt die Thompson-Atomtheorie, dass Atome gleichförmige Kugeln aus positiv geladener Materie mit eingebetteten Elektronen sind. Die Theorie wurde um 1900 von Lord Kelvin vorgeschlagen und von Sir Joseph John Thompson stark unterstützt.
Im Jahr 1897 entdeckte Thompson das Elektron, das ein negativ geladener Teil eines Atoms ist. Das Atommodell von Thompson wurde auch als Plumpudding-Modell bezeichnet. Thompsons Theorie wurde 1911 aus theoretischen und experimentellen Gründen zugunsten des Rutherford-Atommodells aufgegeben, das bewies, dass Thompsons Theorie falsch war. Rutherfords Modell stellte fest, dass ein Atom aus einem kleinen, dichten und positiv geladenen Kern im Zentrum des Atoms besteht, der von negativ geladenen Elektronen umgeben ist.