Einige Beispiele für aerobe Bakterien sind Mycobacterium tuberculosis, das Tuberkulose verursacht, Bakterien der Gattung Nocardia, die Nokardiose verursachen, und Psuedomonas aeruginosa, das Lungenentzündung, Harnwegsinfektionen und Magen-Darm-Probleme verursacht. Vollständig aerob Bakterien haben einen sauerstoffbasierten Stoffwechsel und können ohne Sauerstoff nicht überleben.
Anaerobe Bakterien benötigen keinen Sauerstoff. Die Unterschiede zwischen anaeroben und aeroben Bakterien werden sichtbar, wenn sie in ein Kulturmedium gegeben werden. Die aeroben Bakterien sammeln sich an der Oberfläche des flüssigen Mediums, um der maximalen Sauerstoffmenge ausgesetzt zu sein. Einige Bakterien können Sauerstoff verwenden, brauchen aber keinen; andere Arten können in Gegenwart von freiem Sauerstoff überhaupt nicht überleben.