Die wichtigsten Gewässer in Mexiko sind der Golf von Kalifornien (lokal als Mar de Cortés bekannt), der Golf von Mexiko, der San Juan River und der Chapala-See (der größte Süßwassersee).
Der Golf von Kalifornien ist auch als Sea of Cortez und Vermilion Sea bekannt. Es gilt als großes Gewässer, weil es die kalifornische Halbinsel von Mexiko trennt und eine 4.000 Kilometer lange Küste hat. Der Golf von Mexiko ist 1.500 Kilometer breit und grenzt an Mexiko, Kuba und die US-Bundesstaaten Texas, Louisiana, Mississippi, Alabama und Florida. Laka Chapala, der größte Süßwassersee Mexikos, liegt in den Gemeinden Chapala, Jocotepec, Jamay, Jalisco und Poncitlan. Der San Juan River, einer von vielen Flüssen weltweit mit diesem Namen, gilt als wichtiger Fluss, da er den Bundesstaat Nuevo León mit Wasser versorgt.
Obwohl dies die wichtigsten Gewässer in Mexiko sind, gibt es im Land auch mehrere kleinere Seen, Teiche, Flüsse und Buchten. Die Basaseachic Falls am Basaseachic River sind der zweithöchste Wasserfall in Mexiko und die Piedra Bolada Falls ist der höchste. Viele Flüsse und Seen in Mexiko werden von Landwirten genutzt oder sind beliebte Touristenattraktionen.