Ein Hauptunterschied zwischen Protisten und Bakterien besteht darin, dass Protisten eukaryotische Organismen sind, während Bakterien Prokaryoten sind. Ein weiterer Unterschied besteht darin, dass Protisten zum Königreich Protista gehören, während Bakterien zum Königreich Monera gehören. Bakterien sind einzellige Organismen, die keine Organellen wie einen Zellkern oder Chloroplasten enthalten.
Protisten sind ebenfalls einzellige Organismen, haben jedoch einen Zellkern und andere intrazelluläre Organellen. Beispiele für Protisten sind Amöben und Paramecium.
Einige Ähnlichkeiten zwischen diesen beiden Organismen bestehen darin, dass sie beide einzellige Organismen sein können, die entweder in einer Position bleiben oder sich durch Strukturen wie Geißeln bewegen können. Eine weitere Ähnlichkeit besteht darin, dass Mitglieder jedes Königreichs entweder Autotrophe oder Heterotrophe sein können. Autotrophe können ihre Nahrung herstellen, während Heterotrophe dies nicht tun können.
