Physikalische Unterschiede zwischen Alligatoren und Krokodilen umfassen ihre Hautfarbe, die Form ihrer Kiefer und ihre Zahnstellung. Weitere Unterschiede sind ihre Umgebung und Aggressivität.
Alligatoren haben normalerweise eine dunklere Haut als Krokodile. Alligatoren haben breite, runde Kiefer mit U-förmigen Schnauzen. Krokodile haben schmale, spitze Kiefer mit V-förmigen Schnauzen. Alligatorkiefer sind stärker als Krokodilkiefer und ermöglichen es ihnen, Beute mit harten Schalen zu fressen, während Krokodilkiefer für ein breiteres Beutespektrum konzipiert sind. Die unteren Zähne des Alligators sind bei geschlossenem Maul nicht zu sehen, da sein Oberkiefer breiter ist als sein Unterkiefer. Ober- und Unterkiefer des Krokodils sind gleich groß, und sein vorstehender vierter Zahn am Unterkiefer passt bei geschlossenem Maul außerhalb des Oberkiefers. Alligatoren leben in Süßwasserhabitaten, während Krokodile in Salzwasserhabitaten leben, weil eine Drüse in ihren Zungen Salz loswird. Wilde Alligatoren leben nur in den Vereinigten Staaten und in China. Wilde Krokodile leben auf der ganzen Welt. Krokodile sind tendenziell aggressiver. Es gibt verschiedene Arten von Alligatoren und Krokodilen. Jede Art ist einzigartig, daher gibt es einige Ausnahmen von diesen gemeinsamen Unterschieden. Ein Beispiel ist das indische Straßenräuberkrokodil, das einen breiten Kiefer ähnlich einem Alligator hat, aber auch den prominenten vierten Zahn eines Krokodils hat.