Eines der wichtigsten Beispiele für aerobe Atmung ist die Bildung der Energiequelle ATP durch den Abbau des Zuckers Glukose. Laut Unterrichtsmaterialien des Clinton Community College ist dieser Prozess aerob, da er Sauerstoff benötigt passieren. Während der Dauer des Krebs-Zyklus und der Bildung von Acetyl-CoA nimmt Sauerstoff Elektronen von NAD und FAD auf, die schließlich 34 Moleküle ATP produzieren.
Ein bekanntes Beispiel für die aerobe Zellatmung ist die Umwandlung von Kohlenhydraten und Fett durch den Körper in Energie. Mit anderen Worten, wenn der Körper Fett und Protein verstoffwechselt, kommt es zu einem aeroben zellulären Prozess. Laut Kursnotizen des Indianapolis Department of Biology der Indiana University-Purdue University sind die kohlenhydratarme Atkins-Diät und die South Beach-Diät Beispiele für diesen Prozess. Sie wirken, indem sie dem Körper erlauben, seine natürlichen Glukosereserven zu erschöpfen, was den Körper dazu zwingt, Protein und Fett als Brennstoff zu verbrennen. Wenn beispielsweise der Glukosespiegel des Körpers niedrig ist, wird Lipase freigesetzt, um Fett in seinen Geweben und im Blutkreislauf abzubauen. Schließlich wird das Fett in eine Fettsäure zerlegt, die in Acetyl-CoA umgewandelt wird und in den Kreb-Zyklus eingeht, um mindestens 32 Moleküle ATP zu produzieren.
Der Prozess der Proteinmetabolisierung läuft auf die gleiche Weise ab. In diesem Fall wird Protein in Aminosäuren zerlegt, die schließlich direkt über den Krebs-Zyklus als Acetyl-CoA oder Pyruvat in den Zellatmungsprozess gelangen. Der Prozess liefert wiederum 32 bis 38 Glukosemoleküle.
Pflanzen durchlaufen auch einen Prozess der aeroben Zellatmung, da auch sie Sauerstoff benötigen.