Alle Wasserkörper auf der Erde sind aquatische Biome. Aquatische Biome sind die größten aller Biome, da Wasser etwa drei Viertel des Planeten bedeckt und in zwei Hauptkategorien unterteilt ist: Meer- und Süßwasser.
Meeresbiome sind Salzwasser und umfassen Ozeane, Flussmündungen und Korallenriffe. Diese Biome beherbergen unzählige Tier- und Pflanzenarten. Der größte Teil des Sauerstoffs der Welt wird von Algen bereitgestellt, die in der Meeresregion vorkommen. Ozeane sind das größte marine Biom. Ozeanbiome sind in vier Unterkategorien unterteilt: intertidal, pelagisch, abgrundtief und benthisch. Korallenriffe sind in seichten und warmen Meeresgewässern zu finden. Ästuare werden gebildet, wenn Süßwasser in Salzwasser fließt, was zu einem vielfältigen aquatischen Ökosystem führt.
Süsswasserbiome umfassen Seen, Flüsse, Teiche, Sümpfe und Feuchtgebiete, die eine geringere Salzkonzentration aufweisen als Meeresbiome. Seen und Teiche sind viel kleiner als Ozeane und beherbergen nur einen Bruchteil der Arten, die in Ozeanen vorkommen können. Diese Gewässer sind in zwei Unterkategorien von Biomen unterteilt: die Küstenzone und die Limnetikzone.
Feuchtgebiete umfassen Lichtungen, Sümpfe und Sümpfe. Dies sind im Allgemeinen sehr große Gewässer und Heimat einer großen Vielfalt an Wasserpflanzen und -tieren. Flüsse und Bäche sind auch Teil des Süßwasserbioms. Da sich diese Gewässer ständig bewegen, sind Pflanzen- und Tierarten äußerst vielfältig und variieren je nach Wasserbedingungen und Temperatur.